На главную страницу На странцу первого семестра

Таблица. Измерение торсионных углов остатка Gln10 в белке MAF_BACSU, цепь А Название двугранного угла Угол определяется по координатам атомов (обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol, в скобках - название атома) Данный угол описывает поворот вокруг связи Результат измерения с помощью RasMol φ SER9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А) GLN10:A.N GLN10:A.CA GLN10:A.C Ni - C&alphai -98.69   ψ GLN10:A.N GLN10:A.CA GLN10:A.C SER11:A.N   C&alphai - Ci   4.27   ω GLN10:A.CA GLN10:A.C SER11:A.N SER11:A.CA   Ci - Ni+1   -179.33

Изображение угла phi

На диаграмме видно,что в основном для всех аминокислотных остатков белка характерно положение во второй координатной четверти, т.е. положительный psi и отрицательный phi. Любопытно наблюдение, что почти все аминокислотные остатки, расположенные справа(1-я,4-я четверти)представлены глицином, пролина,кстати,среди них нет.

Существует два центра концентрации соотношения углов phi и psi, одно из них представлено в основной массе аминокислотными остатками, относящимися к альфа-спирали и расположено в верхней части третьей четверти, другое -а.о. из бета-слоёв в верхней части второй.Изменение значения угла для альфа спирали psi - от -70 до 170 , phi- от -150 до 140.Для бета-слоя phi от -180 до -60 , psi от 90 до 180.

Ссылка на скрипт получения изображения Ссылка на первую карту Ссылка на вторую карту

© Zhuravleva Katya, 2009